O BRT provoca alterações em 16 linhas de ônibus que circulam em Salvador. Aquelas que passam pela Avenida Juracy Magalhães, sentido Avenida Garibaldi, e têm como destino o Itaigara terão seu itinerário encurtado. Por conta das intervenções do trecho 2 do BRT que vêm acontecendo na região da Lucaia, estas linhas têm utilizado o primeiro retorno da Avenida Vasco da Gama, aumentando seu trajeto em aproximadamente 3km.
A partir de agora, esse retorno será feito logo após a Embasa, deixando de acessar a Vasco da Gama. Com isso, os ônibus também deixam de parar na entrada da Rua do Canal, parando mais à frente, no ponto do Vale das Pedrinhas, e seguindo daí seu itinerário normal.
Outra novidade é que foi criada uma nova linha de ônibus para atender às regiões da Pituba, Itaigara e Rio Vermelho. Lançada com o objetivo de reduzir o tempo de espera dos usuários durante as obras do BRT, a nova linha é a E-126 -Lucaia x Pituba.
Ela será circular e sairá da praça Nelson Fonseca, na Rua do Canal, passando pela Avenida Juracy Magalhães Júnior, Avenida Antônio Carlos Magalhães, Rua Rio Grande do Sul, Avenida Manoel Dias, Rua Visconde de Itaboraí, Rua Oswaldo Cruz, Largo da Mariquita, Rua do Canal, e retornando para a Praça Nelson Fonseca.
Segundo a Secretaria Municipal de Mobilidade (Semob), ao todo, serão 40 viagens de segunda a sábado, com saídas a cada 20 minutos.